Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp1Q00915 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms