Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Serpina1cQ00896 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Serpina1cQ00896 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms