Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VegfaQ00731 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VegfaQ00731 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms