Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx2Q00262 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms