Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lama4P97927 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lama4P97927 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms