Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
rp9P97762 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
rp9P97762 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
rp9P97762 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
rp9P97762 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
rp9P97762 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms