Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bop1P97452 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Bop1P97452 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bop1P97452 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bop1P97452 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bop1P97452 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Bop1P97452 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms