Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smyd1P97443 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms