Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nbr1P97432 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nbr1P97432 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms