Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TgfbiP82198 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TgfbiP82198 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms