Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx1P81068 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Irx1P81068 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms