Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tp53bp1P70399 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tp53bp1P70399 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms