Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cux2P70298 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cux2P70298 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms