Protein–RNA interactions for Protein: P70168

Kpnb1, Importin subunit beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpnb1P70168 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kpnb1P70168 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kpnb1P70168 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms