Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SbdsP70122 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SbdsP70122 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms