Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tubb4bP68372 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubb4bP68372 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms