Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Acta1P68134 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Acta1P68134 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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