Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crnkl1P63154 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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