Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps3P62908 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms