Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vsnl1P62761 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vsnl1P62761 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms