Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Rps29P62274 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Rps29P62274 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
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