Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Depdc5P61460 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Depdc5P61460 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms