Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abce1P61222 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Abce1P61222 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms