Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ActbP60710 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ActbP60710 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ActbP60710 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ActbP60710 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ActbP60710 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ActbP60710 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms