Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ppfia3P60469 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ppfia3P60469 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms