Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hps5P59438 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hps5P59438 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms