Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Senp1P59110 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms