Protein–RNA interactions for Protein: P58750

Pim3, Serine/threonine-protein kinase pim-3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pim3P58750 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pim3P58750 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pim3P58750 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pim3P58750 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pim3P58750 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms