Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
P58686 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
P58686 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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P58686 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P58686 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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P58686 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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P58686 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P58686 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P58686 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
P58686 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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P58686 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
P58686 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms