Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smpdl3bP58242 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms