Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samsn1P57725 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Samsn1P57725 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms