Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcstnP57716 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms