Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SmoP56726 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SmoP56726 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms