Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Irf5P56477 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms