Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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CartptP56388 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CartptP56388 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CartptP56388 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CartptP56388 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CartptP56388 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CartptP56388 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CartptP56388 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CartptP56388 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CartptP56388 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CartptP56388 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CartptP56388 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CartptP56388 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CartptP56388 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CartptP56388 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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CartptP56388 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CartptP56388 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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CartptP56388 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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CartptP56388 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CartptP56388 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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CartptP56388 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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