Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bp1P55194 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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