Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Aqp4P55088 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Aqp4P55088 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Aqp4P55088 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Aqp4P55088 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Aqp4P55088 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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