Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Lbx1P52955 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lbx1P52955 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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