Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClgnP52194 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms