Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CcnfP51944 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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