Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tmod1P49813 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tmod1P49813 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Tmod1P49813 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmod1P49813 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmod1P49813 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tmod1P49813 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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