Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cox8bP48772 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms