Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd1P48410 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd1P48410 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms