Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli1P47806 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli1P47806 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gli1P47806 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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