Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hmx2P43687 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hmx2P43687 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hmx2P43687 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms