Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ItgavP43406 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms