Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc1a2P43006 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms