Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rpl28P41105 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms