Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sar1aP36536 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms