Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab23P35288 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms